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A principal diferença entre Monofilético e Parafilético é que o Monofilético é uma condição de ser monofilético, de incluir todos os descendentes de uma determinada espécie ancestral e Parafilético é um termo usado na análise cladística.

• Monofilético

  Na cladística, um grupo monofilético é um grupo de organismos que forma um clado, que consiste em todos os descendentes de um ancestral comum. Grupos monofiléticos são tipicamente caracterizados por características derivadas compartilhadas (sinapomorfias), que distinguem organismos do clado de outros organismos. A organização dos membros de um grupo monofilético é chamada monofilia. A monofilia é contrastada com a parafilia e a polifilia, como mostrado no segundo diagrama. Um grupo parafilético consiste em todos os descendentes de um ancestral comum menos um ou mais grupos monofiléticos. Ou seja, um grupo parafilético é quase monofilético, daí o prefixo para, significando próximo. Um grupo polifilético é caracterizado por características convergentes ou hábitos de interesse científico (por exemplo, primatas noturnos, árvores frutíferas, insetos aquáticos). As características pelas quais um grupo polifilético é diferenciado de outros não são herdadas de um ancestral comum. Essas definições levaram algum tempo para serem aceitas. Quando a escola de pensamento cladístico se tornou popular na década de 1960, várias definições alternativas estavam em uso. De fato, os taxonomistas usavam termos sem defini-los, levando a confusão na literatura inicial, uma confusão que persiste. O primeiro diagrama mostra uma árvore filogenética com dois grupos monofiléticos. Os vários grupos e subgrupos estão particularmente situados como galhos da árvore para indicar relações lineares ordenadas entre todos os organismos mostrados. Além disso, qualquer grupo pode (ou não) ser considerado um táxon pela sistemática moderna, dependendo da seleção de seus membros em relação aos seus antepassados ​​comuns; veja o segundo e o terceiro diagramas.

  
  

• Parafilético

  Na taxonomia, um grupo é parafilético se consistir nos grupos do último ancestral comum e em todos os descendentes desse ancestral, com exclusão de alguns subgrupos - tipicamente apenas um ou dois - monofiléticos. Diz-se que o grupo é parafilético em relação aos subgrupos excluídos. A disposição dos membros de um grupo parafilético é denominada parafilia. O termo é comumente usado em filogenética (um subcampo da biologia) e em linguística. O termo foi cunhado para aplicar-se a táxons conhecidos como Reptilia (répteis) que, como comumente denominados e tradicionalmente definidos, são parafiléticos em relação a mamíferos e aves. Reptilia contém o último ancestral comum dos répteis e todos os descendentes desse ancestral - incluindo todos os répteis existentes e os sinapsídeos extintos - exceto mamíferos e aves. Outros grupos parafiléticos comumente reconhecidos incluem peixes, macacos e lagartos. Se muitos subgrupos estiverem faltando no grupo nomeado, diz-se que é poliparafilético. Um grupo parafilético não pode ser um clado, que é um grupo monofilético.

  
  

• Monofilético (adjetivo)

  De, pertencente a, ou afetando um único filo (ou outro táxon) de organismos.

• Monofilético (adjetivo)

  Derivado de um único clado (monófilo).

• Monofilético (adjetivo)

  Descendente de uma única espécie ancestral.

• Monofilético (adjetivo)

  Descendente de uma única espécie ancestral e contendo todos os descendentes desse único ancestral, holofilético.

• Parafilético (adjetivo)

  De um grupo definido de táxons, não incluindo todos os descendentes do ancestral comum de todos os membros.

• Monofilético (adjetivo)

  De ou pertencente a uma única família ou estoque, ou ao desenvolvimento a partir de uma única forma parental comum; - oposto ao polifilético; como origem monofilética.